そもそも朝起きた直後は日々の中で最も口の臭いが強くなります。これを生理的口臭と呼びます。
どうしてそうなるのかというと、寝ている間は、唾液の分泌がほとんどなくなり、口の中で増える微生物を唾液で流して飲み込んだり殺菌することができないからです。
それゆえ、朝目が覚めた直後は口の中の微生物の数が一日のうちで最も多くなり、口臭も強くなるのです。

また、ただの口臭ではなく、異常にくさいというときは

・寝る前の歯磨きが不十分である
・前日に食べたものが口臭を引き起こすようなものだった（お酒、ニンニクなど）
・寝ているときに口で呼吸している（口が乾燥して臭う）
・歯周病である
・かなり重症の虫歯がある
・飲んでいるお薬が口が乾燥する副作用を持っている
・胃の調子が悪い
・内臓に異常があり、体内の代謝がおかしくなっている

あまりにも気になるときは、歯科医院で相談してみてください。